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单拷贝序列

拼音:dānkǎobèixùliè英文:单拷贝序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝序列在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的序列属于这一类。单拷贝序列中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。目前尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝序列中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他部份的功能尚不清楚。在基因组中,单拷贝序列的两侧往往为散在分布的重复序列。由于某些单拷贝序列编码蛋白质,体现了生物的各种功能,因此对这些序列的研究对医学实践

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中度重复序列

拼音:zhōngdùzhòngfùxùliè英文:中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万(105)次的重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序,但慢于高度重复顺序。少数在基因组中成串排列在一个区域,大多数与单拷贝基因间隔排列。依据重复顺序的长度,中度重复顺序可分为两种类型。(1)短分散片段(shortinterspersedrepeatedsegments,SINES)这类重复顺序的平均长度约为300bp(〈500bp),它们与平均长度约为1000bp的单拷贝顺序间隔排列。拷贝数可达10万左

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“电子”基因克隆

因之间无同种或异种基因的匹配。新基因和未知基因将进一步用于生物学研究。基因的电子定位基因的电子定位采用NCBI的电子PCR程序进行检索,寻找EST序列上是否存在序列标签位点(sequencetaggedsites,STS),STS作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。将寻找到的STS与相应的染色体相比较,即可将此序列定位在该染色体上。IMAGE克隆的索取许多ESTs所对应的cDNA克隆可通过基因组及其表达的整合分子分析(i

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单一序列

拼音:dānyīxùliè英文:uniquesequence单一序列又称非重复序列,在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或几个拷贝(1~5个拷贝)。

分类:生物学;

EAV

存在于病毒粒子上;大糖蛋白GL,分子量30-42kDa。在病毒粒子上GL不以单体形式存在,而是与M形成异二聚体。Gs是病毒的次要蛋白,仅占1~2%。但在感染细胞中含量很高。N、M、GL在病毒粒子上含量基本相当,分子比依次是3∶2∶3。EAV基因组全序列已被测定,有7个开放阅读框架(ORF1-7)。亚基因组的引导序列长207nt,来源于基因组5’端非编码区。位于5’端编码病毒复制酶的ORF1又分为两个大的ORF1a和ORF1b,是最大的开放阅读框架,占整个基因组5’端的3/4,ORF1a和ORF1

分类:生物学;病毒;

马动脉炎病毒

存在于病毒粒子上;大糖蛋白GL,分子量30-42kDa。在病毒粒子上GL不以单体形式存在,而是与M形成异二聚体。Gs是病毒的次要蛋白,仅占1~2%。但在感染细胞中含量很高。N、M、GL在病毒粒子上含量基本相当,分子比依次是3∶2∶3。EAV基因组全序列已被测定,有7个开放阅读框架(ORF1-7)。亚基因组的引导序列长207nt,来源于基因组5’端非编码区。位于5’端编码病毒复制酶的ORF1又分为两个大的ORF1a和ORF1b,是最大的开放阅读框架,占整个基因组5’端的3/4,ORF1a和ORF1

分类:生物学;病毒;

物理图谱

列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。以人类基因组物理图谱为例,它包括两层含义,一是获得分布于整个基因组30000个序列标志位点(STS,其定义是染色体定位明确且可用PCR扩增的单拷贝序列)。将获得的目的基因的cDNA克隆,进行测序,确定两端的cDNA序列,约200bp,设计合成引物,并分别利用cDNA和基因组DNA作模板扩增;比较并纯化特异带;利用STS制备放射性探针与基因组进行原位杂交,使每隔100kb就有一个标志;二是在此

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DNA复性

与DNA浓度的平方成正比。即溶液中DNA分子越多,相互碰撞结合“成核”的机会越大。DNA顺序的复杂性。简单顺序的DNA分子,如多聚(A)和多聚(U)这二种单链序列复性时,互补碱基的配对较易实现。而顺序复杂的DNA,如小牛DNA的非重复部分,一般以单拷贝存在于基因组中,这种复杂特定序列要实现互补,显然要比上述简单序列困难得多。在核酸复性研究中,定义了一个Cot的术语,(Co为单链DNA的起始浓度,t是以秒为单位的时间),用以表示复性速度与DNA顺序复杂性的关系。在探讨DNA顺序对复性速度的影响时

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藻类DNA病毒科

水化合物:绿藻病毒属PBCV-1至少有三种蛋白质被糖基化,包括主要的外壳蛋白Vp54。Vp54被糖基化的部分位于病毒粒子的外表面。不像其他未知病毒,PBCV-1好像至少编码一些糖基化的酶。基因组结构和基因组的复制:绿藻病毒属PBCV-1的的基因组的序列已经被测定,基因组的大小为333.747kb,此病毒共编码701个开放型阅读框,据预测,其中的376个开放型阅读框编码的是蛋白质。大约有40%的开放型阅读框在数据库中能找到相对应的蛋白质。PBCV-1的两个基因中有内含子插入:一个像基因一样的转录因

分类:生物学;病毒;

PCR实验技术

虑:模板有没有问题?(DNA样品中发现有多种污染物会抑制PCR。一些在标准基因组DNA制备中使用的试剂,如SDS,在浓度低至0.01%时就会抑制扩增反应。)所需的最佳模板量取决于基因组的大小。你的目的片段在基因组中占多少?至少要保证模板中含有一个单拷贝吧!100ng到1µg的人类基因组DNA,相当于3×104到3×105个分子。所以对于单拷贝基因,这需要0.1μg的人基因组DNA,10ng的酵母DNA,1ng的大肠杆菌DNA.扩增多拷贝序列时,用量更少.灵敏的PCR可从一个细胞,一

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